
Di bawah doktrin Teori Kiamat Quirk, kelompok ideologis Humarise yakin bahwa semua manusia dengan quirk adalah penyakit dan harus dibasmi. Untuk membangun kembali dunia, para ekstremis kelompok tersebut telah membangun alat mematikan yang dikenal sebagai “Bom Pemicu” yang menyebabkan orang-orang dengan quirk kehilangan kendali dan mati. Pemimpin mereka, Flect Turn, berhasil lolos dari penangkapan para Pahlawan Pro yang tersebar di seluruh dunia.
Selama masa studi kerjanya di negara Otheon bersama Pahlawan Pro nomor satu Jepang, Izuku “Deku” Midoriya, dituduh melakukan kejahatan yang tidak dilakukannya. Tanpa sengaja melibatkan Roddy Soul, seorang penduduk setempat, Deku segera mendapati dirinya dalam pelarian bersama bocah itu. Kini giliran Rody, Deku, dan teman-teman sekelas Deku untuk menghentikan rencana Bom Pemicu yang digagas Flect, sambil menghindari anggota Humarise lainnya yang gigih.