Trigun Stampede menceritakan Vash the Stampede, seorang penembak legendaris dengan buronan besar yang dijuluki Humanoid Typhoon, meski sebenarnya ia membenci kekerasan dan tidak ingin membunuh.
Di planet tandus Noman’s Land, Vash terus diburu pemburu hadiah sambil berusaha melindungi orang-orang di sekitarnya. Perjalanannya perlahan mengungkap masa lalunya yang kelam dan konflik besar dengan saudara kembarnya, Millions Knives, yang mengancam umat manusia.
